Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D131 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D131 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D131 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D131 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D131 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D131 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D131 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D131 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D131 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D131 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D131 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D131 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D131 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D131 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D131 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D131 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D131 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D131 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D131 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D131 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D131 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms