Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc5Q9D0F6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc5Q9D0F6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms