Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd1Q9D0E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lysmd1Q9D0E3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd1Q9D0E3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd1Q9D0E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd1Q9D0E3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd1Q9D0E3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd1Q9D0E3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd1Q9D0E3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms