Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thumpd2Q9CZB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Thumpd2Q9CZB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms