Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nsfl1cQ9CZ44 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nsfl1cQ9CZ44 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsfl1cQ9CZ44 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms