Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CYI0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9CYI0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9CYI0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CYI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9CYI0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYI0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms