Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins3Q9CY94 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins3Q9CY94 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gins3Q9CY94 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms