Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RpainQ9CWY9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpainQ9CWY9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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