Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd12Q9CWU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd12Q9CWU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd12Q9CWU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms