Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms