Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snw1Q9CSN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snw1Q9CSN1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snw1Q9CSN1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms