Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pard3bQ9CSB4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pard3bQ9CSB4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pard3bQ9CSB4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms