Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdelr2Q9CQM2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kdelr2Q9CQM2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdelr2Q9CQM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdelr2Q9CQM2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms