Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CenpmQ9CQA0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpmQ9CQA0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpmQ9CQA0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms