Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl49Q9CQ40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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