Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bap1Q99PU7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bap1Q99PU7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bap1Q99PU7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms