Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn6Q99PL6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn6Q99PL6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms