Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RetnQ99P87 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetnQ99P87 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetnQ99P87 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms