Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6dQ99N07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6dQ99N07 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6dQ99N07 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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