Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prss29Q99MS4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss29Q99MS4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss29Q99MS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms