Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col25a1Q99MQ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col25a1Q99MQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col25a1Q99MQ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms