Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rcbtb2Q99LJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rcbtb2Q99LJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rcbtb2Q99LJ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms