Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcc1Q99LI2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcc1Q99LI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms