Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp16Q99LG0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp16Q99LG0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms