Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PpifQ99KR7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpifQ99KR7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms