Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab28Q99KL7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab28Q99KL7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab28Q99KL7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms