Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vwa5aQ99KC8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vwa5aQ99KC8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa5aQ99KC8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms