Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pacsin3Q99JB8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pacsin3Q99JB8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms