Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddb2Q99J79 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddb2Q99J79 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddb2Q99J79 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddb2Q99J79 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddb2Q99J79 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddb2Q99J79 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddb2Q99J79 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms