Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhdcQ99J23 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GhdcQ99J23 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GhdcQ99J23 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms