Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn16Q925N4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn16Q925N4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn16Q925N4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms