Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Supt16hQ920B9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt16hQ920B9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt16hQ920B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt16hQ920B9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms