Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SncbQ91ZZ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SncbQ91ZZ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SncbQ91ZZ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms