Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab4bQ91ZR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab4bQ91ZR1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab4bQ91ZR1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms