Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2b1Q91ZM2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2b1Q91ZM2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2b1Q91ZM2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2b1Q91ZM2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms