Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdha1Q91Y21 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms