Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha11Q91Y19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha11Q91Y19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha11Q91Y19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms