Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx15Q91WE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx15Q91WE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx15Q91WE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx15Q91WE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms