Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csde1Q91W50 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csde1Q91W50 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csde1Q91W50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csde1Q91W50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms