Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Farp2Q91VS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Farp2Q91VS8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Farp2Q91VS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Farp2Q91VS8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Farp2Q91VS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms