Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ApofQ91V80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms