Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TraipQ8VIG6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TraipQ8VIG6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TraipQ8VIG6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms