Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Barhl2Q8VIB5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Barhl2Q8VIB5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms