Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms