Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark1Q8VHJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mark1Q8VHJ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mark1Q8VHJ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark1Q8VHJ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mark1Q8VHJ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms