Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmcd1Q8VEE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmcd1Q8VEE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmcd1Q8VEE1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms