Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul7Q8VE73 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cul7Q8VE73 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cul7Q8VE73 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms