Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39cQ8VE09 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39cQ8VE09 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Ttc39cQ8VE09 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Ttc39cQ8VE09 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Ttc39cQ8VE09 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc39cQ8VE09 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Ttc39cQ8VE09 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39cQ8VE09 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Ttc39cQ8VE09 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Ttc39cQ8VE09 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Ttc39cQ8VE09 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Ttc39cQ8VE09 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39cQ8VE09 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39cQ8VE09 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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