Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1Q8VDF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1Q8VDF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms