Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fyco1Q8VDC1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Fyco1Q8VDC1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fyco1Q8VDC1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fyco1Q8VDC1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms